與其他罪的區別主要體現在故意傷害罪上：‌ 兩罪的關鍵區別在于‌實行行為‌和‌行為目的‌——組織出賣人體器官罪的實行行為是‌組織行為‌，側重于管理秩序的破壞；故意傷害罪則是‌故意非法損害他人身體健康‌的行為，如破壞組織完整或器官機能，側重于對身體健康的直接侵害.。具體區分時，若摘取器官未經本人同意、摘取未成年人器官或強迫、欺騙捐獻，即使有“出賣”形式，也直接認定為故意傷害罪或故意殺人罪。此外，若在組織過程中‌故意傷害他人身體‌，應以故意傷害罪處理.。‌
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